Ngày 15 tháng 12 năm 1992, Phòng Y tế Hóc Môn đã xây dựng đề án mô hình
Trung tâm Y tế huyện Hóc Môn và đã được Ủy ban nhân dân huyện Hóc Môn thông qua trên chứng từ số 845-UB ngày 25-12-1992. Hóc Môn là một huyện ngoại thành nằm về hướng Tây Bắc TP. Hồ Chí Minh, cách trung tâm thành phố 20km. Căn cứ vào đề án trên, ngày 14 tháng 3 năm 1994, Ủy ban Nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh đã ban hành Quyết định số 724/QĐ-UB-NC về việc thành lập
Trung tâm Y tế huyện Hóc Môn.
Ngày 28 tháng 6 năm 1994,
Trung tâm y tế huyện Hóc Môn đã chính thức ra mắt và chọn đó là ngày kỷ niệm thành lập. Đến năm 1997 tách 1 phần
Trung tâm Y tế huyện Hóc Môn ra hình thành Trung tâm Y tế Quận 12. Đến ngày 26 tháng 07 năm 2007, theo Quyết định số 98/2007/QĐ-UBND của UBND Thành phố Hồ Chí Minh, Bệnh viện Hóc Môn được thành lập trên cơ sở sắp xếp lại
Trung tâm Y tế huyện Hóc Môn. Bệnh viện chịu sự quản lý, chỉ đạo trực tiếp của Ủy ban nhân dân huyện Hóc Môn và Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minh.
Bệnh viện Đa khoa khu vực Hóc Môn chính thức được thành lập theo Quyết định số 5524/QĐ-UBND, ngày 22 tháng 12 năm 2008 của Ủy ban nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh. Bệnh viện Đa khoa khu vực Hóc Môn chịu sự quản lý, chỉ đạo trực tiếp và hướng dẫn về chuyên môn kỹ thuật của Sở Y tế. Vào ngày 26 tháng 07 năm 2007, theo Quyết định số 98/2007/QĐ-UBND TPHCM,
bệnh viện Hóc Môn được thành lập dựa trên việc tái cấu trúc
Trung tâm Y tế huyện Hóc Môn. Bệnh viện chịu sự giám sát và chỉ đạo trực tiếp từ Ủy ban nhân dân huyện Hóc Môn cùng với Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minh.
Sau đó, theo Quyết định số 5524/QĐ-UBND, ngày 22/12/2008,
bệnh viện Đa khoa Khu vực Hóc Môn chính thức được thành lập. Bệnh viện vẫn dưới sự quản lý, chỉ đạo trực tiếp và hướng dẫn về chuyên môn kỹ thuật từ Sở Y tế. Hiện nay,
bệnh viện Đa khoa Khu vực Hóc Môn được xếp hạng II và trực thuộc Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minh.
Bệnh viện Đa khoa Khu vực Hóc Môn đang trong giai đoạn đổi mới và nâng cấp với quy mô 1.000 giường bệnh tiêu chuẩn theo phương hướng hiện đại. Giai đoạn đầu tiên tập trung vào xây dựng 500 giường chất lượng cao, gồm một khu vực phòng khám và các chuyên khoa đặc biệt với trang thiết bị tiên tiến.
Bên cạnh đó, bệnh viện cũng được trang bị một sân đỗ trực thăng ở tầng 12 để đảm bảo có thể nhận bệnh cấp cứu qua đường hàng không. Bên cạnh đó, theo kế hoạch các năm tiếp theo, bệnh viện mục tiêu xây dựng thêm 500 giường nội trú để đáp ứng nhu cầu mở rộng khi cần thiết.Ngoài ra, Khoa cấp cứu và các chuyên khoa nội trú của
bệnh viện Đa khoa Khu vực Hóc Môn vẫn hoạt động bình thường vào Thứ Bảy và Chủ Nhật, tức là luôn sẵn sàng tiếp nhận và xử lý các tình huống cấp cứu y tế.
Thông tin về thời gian làm việc và thời gian tiếp nhận bệnh nhân là quan trọng để người dân có thể lên kế hoạch đến bệnh viện để tiếp nhận chăm sóc y tế theo đúng thời gian hoạt động của bệnh viện.Hiện tại,
bệnh viện Đa khoa Khu vực Hóc Môn hoạt động với 20 chuyên khoa khám chữa bệnh sau: Khoa Nội thận, Khoa Chẩn đoán hình ảnh, Khoa Nhi, Khoa Nội thần kinh, Khoa Khám bệnh, Khoa Cấp cứu tổng hợp, Khoa ICU - Hồi sức tích cực, chống độc, Khoa Nội tổng hợp, Khoa Nội tim mạch, lão học, Khoa Nội tiết, Khoa Phụ sản, Khoa Phẫu thuật, Gây mê hồi sức, Khoa Ngoại chỉnh hình bỏng, Khoa Ngoại tổng quát, Khoa Liên chuyên khoa, Khoa Y học cổ truyền, Khoa Vật lý trị liệu, phục hồi chức năng, Khoa Xét nghiệm, Khoa Kiểm soát nhiễm khuẩn, Khoa Dược, Tổ dinh dưỡng, tiết chế.
Trước 1975, Hóc Môn là một trong tám quận của tỉnh Gia Định (Hóc Môn, Gò Vấp, Thủ Đức, Nhà Bè, Cần Giờ, Quảng Xuyên, Bình Chánh). Sau ngày giải phóng, Hóc Môn là một trong sáu huyện ngoại thành, địa giới lãnh thổ có thay đổi do sát nhập thêm hai xã Thạnh Lộc, An Phú Đông (trước thuộc quận Gò Vấp) nâng tổng số xã lên 14 xã, và trong quá trình phát triển cũng như nhu cầu quản lý hành chánh, huyện Hóc Môn thành lập thêm một thị trấn Hóc Môn và 2 xã là xã Bà Điểm và xã Tân Chánh Hiệp, tách từ xã Tân Thới Nhì, Tân Thới Nhất, Trung Mỹ Tây và Đông Hưng Thuận. Ranh giới huyện phía Bắc giáp huyện Thuận An (tỉnh Sông Bé) và quận Gò Vấp, phía Tây giáp huyện Đức Hòa (tỉnh Long An). Tổng số diện tích tự nhiên 165,76km2, dân số 295.245 người (số liệu năm 1993). Hộ nông nghiệp chiếm 52% tổng số, thành phần dân tộc dân cư địa phương khá thuần nhất, 90% là người Việt.
Bệnh viện Đa khoa khu vực Hóc Môn được xếp hạng II trực thuộc Sở Y tế Thành phố Hồ Chí Minha. Sẵn sàng tiếp nhận 24/24 giờ tất cả nhân dân có nhu cầu được chăm sóc sức khỏe hoặc từ các bệnh viện khác chuyển đến để cấp cứu, khám bệnh, chữa bệnh. Tuyệt đối không phân biệt nhân dân trong khu vực với ngoài khu vực hoặc ngoài tỉnh. Có đội cấp cứu ngoại viện sẵn sàng đến cấp cứu hoặc đến rước bệnh khẩn cấp khi có yêu cầu của nhân dân. Sẵn sàng chuyển người bệnh lên tuyến trên bằng xe ô tô chuyên dụng khi vượt quá khả năng điều trị của bệnh viện, đồng thời có đội xe chuyên dụng sẵn sàng đưa rước bệnh theo yêu cầu.
Tiếp nhận tất cả các trường hợp có nhu cầu khám sức khỏe và chứng nhận trình trạng sức khỏe của nhân dân theo qui định của pháp luật; Đồng thời có đủ tư cách pháp nhân ký hợp đồng với các tổ chức, công ty để khám sức khỏe định kỳ cho công nhân, người lao động khi có yêu cầu.a. Thường xuyên tổ chức nghiên cứu các đề tài y học cấp cơ sở, hợp tác với tổ chức, cá nhân nghiên cứu hỗ trợ, viết luận văn tốt nghiệp sau đại học. Mở rộng, nghiên cứu điều trị bằng thuốc y học cổ truyền và các phương pháp điều trị không dùng thuốc như: tập vật lý trị liệu – phục hồi chức năng, châm cứu, quang châm, xoa bóp …
Kết hợp với các bệnh viện tuyến trên như Bệnh viện Nhân dân 115, Bệnh viện Bình Dân, Bệnh viện Hùng Vương, Bệnh viện Trưng Vương, Bệnh viện Chấn Thương Chỉnh hình, Bệnh viện Tai Mũi Họng, . . . phát triển kỹ thuật mới, tiên tiến như mổ nội soi, nội soi dạ dày, đại tràng, chụp X quang kỹ thuật số, chụp CT Scaner (citi), mổ trĩ bằng phương pháp Longo, nội soi chẩn đoán thuộc chuyên khoa Tai – Mũi – Họng, xét nghiệm huyết học, sinh hóa nhiều thông số.